Kill la Kill Sub Indo BD Batch : Menceritakan tentang seorang wanita bernama Ryuuko Matoi yang berkeliaran di bawah tanah untuk mencari pembunuh yang telah membunuh ayahnya. Petunjuk satu-satunya yang ia punya adalah hilangnya setengah penemuan dari ayahnya dan tersisa senjata seperti Pisau Gunting yang ia gunakan sekarang. Lalu ia pergi ke Akademi Honnouji yang merupakan sekolah menengah bergengsi tidak seperti yang lain. Akademi ini di pimpin oleh ketua dewan siswa yang mengesankan namun berhati dingin yang bernama Satsuki Kiryuuin bersama bawahannya yang kuat atau Elite Four. Dan Satsuki juga akan memberikan pakaian khusus bernama “Seragam Goku” kepada mereka yang dapat bertahan sampai akhir dan akan mendapatkan kemampuan super unik.
Mengikuti pertarungan antar siswa berseragam dengan kekuatan-kekuatan unik, Ryuuko mundur ke rumahnya yang hancur di mana dia menemukan Senketsu, “Kamui,” atau Pakaian Dewa yang langka dan hidup. Setelah bersentuhan dengan darah Ryuuko, Senketsu terbangun, menempel padanya dan memberinya kekuatan besar. Sekarang, dipersenjatai dengan Senketsu dan Pisau Gunting, Ryuuko melawan Elite Four, berharap untuk mencapai Satsuki dan mengungkap pelaku di balik pembunuhan ayahnya untuk selamanya.