Dr. Stone Season 2 Sub Indo Batch : Senkuu masih bertujuan untuk memulihkan dunia dengan memulihkan manusia yang berubah menjadi patung batu menjadi seperti semina. Namun, terdapat satu orang yang menghalangi tujuannya yaitu Tsukasa Shishiou, yang merupakan pria terkuat dan menentang perilaku Senkkuu. Menurutnya dunia harus menjadi seperti sekarang tanpa orang dewasa sehingga tidak terjadi keserakahan dan ketamakan.
Disaat musim salju akan berakhir, Senkuu dan teman-temannya yang membantu dari Desa Ishigami menyelesaikan persiapan untuk menyerang Kekaisaran Tsukasa. Dengan memiliki telepon yang mereka ciptakan, Kerajaan sains kini siap meluncurkan skema terbarunya untuk merekrut sejumlah besar tentara Tsukasa ke pihak mereka. Namun, mereka juga harus bertarung dengan waktu, karena semakin lama mereka menjalankan rencana mereka, maka semakin besar pula kekaisaran Tsukasa.
Bersatu kembali dengan teman lama dan mendapatkan sekutu baru, Senkuu dan Kerajaan Ilmu Pengetahuan harus menghentikan pasukan Tsukasa untuk memenuhi tujuan mereka memulihkan umat manusia dan semua ciptaannya. Dengan kedua belah pihak masing-masing mengejar dunia ideal mereka.
